Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP107P57740 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms