Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BACE1P56817 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BACE1P56817 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BACE1P56817 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BACE1P56817 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BACE1P56817 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BACE1P56817 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms