Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDC34P49427 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDC34P49427 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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