Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms