Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ME1P48163 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ME1P48163 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ME1P48163 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms