Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms