Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERPINB3P29508 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERPINB3P29508 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms