Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD38P28907 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD38P28907 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD38P28907 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD38P28907 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms