Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD1P28340 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms