Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX2P28328 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX2P28328 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX2P28328 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms