Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1P23471 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms