Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms