Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms