Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PTPRAP18433 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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