Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms