Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD8P13378 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms