Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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DEFA4P12838 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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DEFA4P12838 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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DEFA4P12838 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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DEFA4P12838 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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DEFA4P12838 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DEFA4P12838 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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