Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DMDP11532 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DMDP11532 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DMDP11532 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DMDP11532 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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