Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms