Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGA3P0DJD8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms