Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSD2O96028 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms