Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCATO75600 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCATO75600 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCATO75600 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCATO75600 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCATO75600 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCATO75600 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCATO75600 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms