Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms