Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRAMEF10O60809 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF10O60809 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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