Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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