Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1AO15047 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms