Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCRL2O00421 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCRL2O00421 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms