Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms