Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HACD1B0YJ81 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms