Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms