Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms