Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms