Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLA2G4CQ9UP65 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLA2G4CQ9UP65 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms