Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms