Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF11Q9UIL8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms