Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms