Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms