Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC88CQ9P219 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms