Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCHIP1Q9P0W5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms