Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNIH4Q9P003 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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