Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms