Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM8Q9NQV8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms