Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms