Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMURF2Q9HAU4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms