Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms