Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP2-4Q9BYR9 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms