Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED18Q9BUE0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms