Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RSG1Q9BU20 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms