Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms