Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf85Q96MD7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms